ההתייחסות לפרט – ההתייחסות לפרט היא היעד המרכזי של צהרוני ניצנים. המוטו הינו "הילד במרכז". גישה זו היא המאפשרת הקניית מיומנויות חברתיות, רגשיות וקוגניטיביות לילדים, בדרך חווייתית ומעשירה.
 בטיחות ובטחון – בטיחות הילדים במסגרות החינוכיות השונות היא הבסיס עליו אנו נשענים בכל מתחמי הפעילות.
צוותים חינוכיים – צוותי הצהרונים הינם מקצועיים ומסורים. לאורך השנה מקיים משרד החינוך הכשרות עבור הצוותים, הנחייה, הדרכה וליווי מטעם אנשי מקצוע מעיריית ירושלים, משרד החינוך ועמותת לביא.
תכנים חינוכיים – עבור הצהרונים נבנות תוכניות העשרה חינוכיות מגוונות, הכוללות פעילויות ייעודיות לכל אחד מרכיבי סדר היום. התכנים מועברים משחקי חברה, משחקי תנועה, יצירות, פעילויות חקר, שיח ועוד.
תזונה בריאה – מתן ארוחת צהרים בריאה ומזינה, בניית תפריט מטעם תזונאיות של משרד החינוך. מפעלי ההזנה מפוקחים על ידי משרד החינוך.